عدد مآذن المسجد الأقصى أربعة مآذن موزعة على الرواقين الشمالي والغربي، وهي كالتالي:
مئذنة باب الأسباط (المئذنة الصلاحية)
تقع في الجهة الشمالية للمسجد الأقصى بين باب حطة والأسباط. تعتبر المئذنة الوحيدة أسطوانية الشكل في المسجد.
مئذنة باب الغوانمة (مئذنة السرايا ، منارة قلاوون)
تقع في الطرف الشمالي الغربي للمسجد الأقصى بجانب باب الغوانمة. تعتبر أعلى مآذن المسجد وأعظمها بناءً وإتقاناً في الزخارف.
مئذنة باب السلسلة (منارة المحكمة)
تقع فوق الرواق الغربي للمسجد الأقصى بجانب باب السلسلة.
مئذنة باب المغاربة (المنارة الفخرية)
تقع في الزاوية الجنوبية الغربية للمسجد الأقصى بالقرب من باب المغاربة و بجانب المتحف الإسلامي ومكتبة المسجد الأقصى. أنشأت في الفترة المملوكية على يد القاضي شرف الدين عبد الرحمن بن الصاحب الوزير فخر الدين الخليلي. تعتبر أصغر مآذن المسجد الأقصى، ويحيط بها حقل من أشجار الزيتون.